Working girl...

Juste parce que c'est beau, et que ce sont mes résolutions de janvier 2005 after all...

LIJ:
--> finir sélection double mutants / remonter aux populations avec notes de Jo
. phyAlij = trouver pop qui ne ségrége pas = double homozygote
. phyBlij : idem
. crylij : F2 testée = vérifier la descendance maintenant, trouver pop homogène. Tous devraient être cry1 homozygote.
--> cotyledons (+ éventuellement hypocotyles mais pas nécessaire) de :
. phyAlij/phyA/lij/Ler/Ws
. phyBlij/phyB/lij/Ler/Ws
. cry1lij/cry1/lij/Ler/Ws
en B, R, FR
--> mapping :
. vérifier les marqueurs C6, C464947, NGA162 sur TAIR website
. trouver les primers dans les boites d'Olivia
. tester sur Ws / Col / Het
--> continuer tail-PCR sur les 2 borders.

RUBY :
-->seedling physiology :
. refaire rubyphyB/phyB/ruby/Ws cots et hypocotyles (car différence en dark sur mes data) en RL
. faire complete red fluence expt pour rubyphyD+/WsD+/Ws/ruby
. refaire effet température sur cots sur phyB/rubyphyB/ruby/Ws
-->RT-PCR quantitative:
. pif3/spt/pil1/rbcs/cab + AtXgXXXXX
. sur red light grown + dark pour ws et ruby.
. a refaire si besoin est avec 2 time points
--> Adult plants :
. finir flowering experiment.
. envisager de faire rubyphyB/ruby/phyB/Ws en LD, à au moins une température
. prendre photos des rosettes rubyphyB/ruby/phyB/WS/rubyphyD+/WsD+ en SD cool température.
. croisements (cf. liste)
--> AtXgXXXXX
. finir co-ségrégation phénotype ruby / PCR band
. prendre photo/transplanter insertion line numéro 3
. tester insertion lines 1 et 2
. RT-PCR quantitative sur ruby, puis quand nettoyées sur insertions lines
. Analyser la séquence de promoteur de AtXgXXXXX / promoteur formé par le T-DNA
. Analyser la séquence du gène pour trouver motifs protéiques
. Contacter Paul xxxxxx pour infos sur ce gène dans ses chips (ou tout gène similaire)
. Lorsque les insertions lines clean + vérifiées, faire pousser en parallèle de Col-phyB
-->Continuer Tail-PCR sur la right border.

Croisements à faire:
rubyphyB x rubyphyD+
rubyD+ x pif3
rubyD+ x elf3
rubyD+ x dfl1
rubyphyB x pif3
rubyphyB x elf3
ruby x col
ruby x phyE
(pif3 (poc1) = Feldman tag, ask Karen for the border)

Selections en cours:
ruby.phyC: F1 about to flower, select for the presence of 2 tags + check the phenotype of the F2, note the ruby-like, will need to go to F3
ruby.talGFP, ruby.tubGFP: semer les graines, verifier presence de GFP et de ruby, selectionner sur phénotype ruby, aller en F3 pour trouver pop homozygote ruby. Pas besoin d’etre homozygote pour GFP.
ruby.physGFP: récolter (when ready) + semer pop GFP+/ruby+ et trouver pop homogène en F3.
Ws.dfl1 : F1 : semer, vérifier phénotype (nain), croiser a rubyD+

Allez, un 5eme café...